有关SOA的争议不可避免地涉及到了IBM和微软在XML标准问题上的争斗。作为一项支撑SOA应用数据交互的关键标准，微软所支持的是其内部开发的OOXML(Office Open XML)，而IBM使用和支持ODF(OpenDocument Format)。
围绕Windows平台是否够开放、及其对SOA架构支持能力的争论只是事件的表象，这更像是两大软件巨头瓜分SOA庞大市场拉锯战的“导火索”。
IBM软件部经理 Steven Mills日前在接受国外媒体采访时抨击微软的SOA实现方式，指责其过于依赖基于Windows的专有标准，提供的是一种“轻量级消息基础设施”，而在部署SOA的过程中，用户会因此受到强调连接微软兼容流程的阻碍。Mills表示，IBM致力于做各种平台、各种应用的集成工作;而微软所做的只是为那些运行在Windows平台的应用提供连接能力。这就是两家公司在SOA实现方式上呈现的巨大反差。
作为一种功能组件化的设计模型，SOA通过把业务应用连接成为服务的方式实现了IT应用的简单化集成。这种新一代的架构技术可以屏蔽不同平台、编程语言、操作系统和硬件架构之间的差异，用户可以基于Web服务、XML(可扩展标记语言)等通用标准构建跨越式的信息交互体系。而为了提供强大且便捷的集成能力，SOA要求支持厂商采用开放标准连接应用，这些应用可以由第三方厂商或企业自行开发。
从IBM的视角和逻辑出发，微软支持SOA的出发点有些“自私”。Mills说：“微软的目的是实现Windows环境的连接，只要你使用微软的技术，那么就可以实现平台和应用的连接。而IBM所做的是，把每个环境都连接起来，不管用户使用微软还是其他厂商的技术。”为此，Mills重申了IBM在XML和Web服务方面对开放标准的支持。
Mills表示，IBM在实现SOA的过程中采用垂直方式实现库存管理和交易控制的自动化，并使之成为垂直流程，这样做是为了避免业务流程模型中交易的摩擦。他认为，微软不能为用户提供确保交易完整性的持续访问流，微软面向开发者提供的MSDN信息服务局限在消息环境中，这种“轻量级消息基础设施”所实现的是Windows系统间的消息交互，不涉及交易功能，也不能覆盖SOA的全部内容。
有关SOA的争议不可避免地涉及到了IBM和微软在XML标准问题上的争斗。作为一项支撑SOA应用数据交互的关键标准，微软所支持的是其内部开发的OOXML(Office Open XML)，而IBM使用和支持ODF(OpenDocument Format)。ODF是获得ISO认证的开源标准，而OOXML却被ODF联盟和开源社区的许多人认为是专有标准。虽然OOXML已经获得了Ecma国际标准组织的认证，并且微软正在努力使其被接纳为ISO标准。
目前，微软尚没有对IBM的批评做出回应。而无论双方辩论的结果如何，最终都将延伸到软件厂商对市场利益的博弈。对于一个有着明确发展方向和难以估算具体价值的未来大市场，软件企业在技术、标准、商业模式方面的储备，甚至辩论技巧的积累都需要从现在开始。
